我国科研团队建成“数字家蚕”共享分析平台
2023-11-14 12:35 来源：每日看点快看
本文转自：新华网
记者从西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室获悉，实验室代方银教授团队取得最新科研成果——“数字家蚕”共享分析平台，对于推动家蚕泛基因组成果在功能基因组、基因组选择和分子设计育种等方面的研究应用具有重要意义。相关研究成果近日在国际学术期刊《核酸研究》在线发表。
在现代蚕学研究和育种实践中，泛基因组序列和多组学数据已经成为科学家手中不可或缺的基础资源，可以缩短研究和育种的时间，显著提高工作效率。然而，多组学大数据的整合分析和使用具有成本高、技术难度大的特点。
代方银介绍，分析平台不仅涵盖家蚕基因序列信息，还整合了家蚕基因表达、调控、功能研究等数据，提供了开展比较基因组和功能基因组等方面研究的分析工具。
“数字家蚕”共享分析平台数据和功能示意图。（受访者供图）
这是继2022年该团队发布家蚕超级泛基因组图谱后，推动创建“数字家蚕”取得的又一重大进展。分析平台整合了家蚕泛基因组序列及多组学数据，将一个具有上千个种质资源的线下实体基因资源库转化为组学序列数据库并搬上互联网，实现种质资源基因组、遗传变异及表型等数据的开放共享和可视化分析。
“我们将它比喻为一部智能、高效的家蚕基因‘数字字典’或超级‘图书馆’，研究人员能在这里快速获取家蚕基因组相关信息。”西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室博士后陆昆鹏说。
